| MEGAWASTE-EKOTERM, s.r.o. | Prostějov | 20 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,1 t | 1,07 MW |
| MAIER CZ, s.r.o. | Prostějov | 9 | oxid uhličitý 17,0 t | 4,93 MW |
| SLÉVÁRNA ANAH Prostějov, s.r.o. | Prostějov | 7 | oxidy síry vyjádřené jako oxid siř 8,3 t | nevykázán |
| Průmyslové čištění s.r.o. | Mostkovice | 7 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,6 t | nevykázán |
| Alena Sekaninová Kompostárna | Vrbátky | 7 | amoniak a soli amonné vyjádřené ja 0,0 t | nevykázán |
| Mubea Stabilizer Bar Systems s.r.o. | Prostějov | 6 | oxid uhelnatý (CO) 21,3 t | 1,88 MW |
| Toray Textiles Central Europe s.r.o. | Prostějov | 6 | oxid uhelnatý (CO) 10,3 t | 20,98 MW |
| DT Mostárna, a.s. - lakovna | Prostějov | 6 | těkavé organické látky (VOC) 3,1 t | 1,69 MW |
| LACHMAN INTERIER DESIGN, s.r.o. | Prostějov | 6 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,4 t | 0,41 MW |
| Ředitelství silnic a dálnic ČR - Středisko mostních | Brodek u Prostějova | 6 | organické látky vyjádřené jako cel 0,1 t | 0,33 MW |
| Cukrovar Vrbátky a.s. | Vrbátky | 5 | oxid uhelnatý (CO) 438,3 t | 76,98 MW |
| Zemědělské družstvo Vícov - výroba bioplynu - BSP Ví | Vícov | 5 | oxid uhelnatý (CO) 7,6 t | 1,44 MW |
| Mubea Stabilizer Bar Systems Hala 3 | Prostějov | 5 | oxid uhelnatý (CO) 10,2 t | 1,20 MW |
| Saint-Gobain Construction Products CZ a.s. - závod P | Prostějov | 5 | oxid uhelnatý (CO) 2,9 t | nevykázán |
| Mubea IT Spring Wire s.r.o. | Prostějov | 5 | oxid uhelnatý (CO) 5,7 t | 2,45 MW |
| Strojírny Prostějov | Prostějov | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 2,3 t | 1,19 MW |
| Futures - povrchové úpravy | Vranovice-Kelčice | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 2,6 t | 0,74 MW |
| SIGNUM spol. s r.o. - závod Prostějov | Prostějov | 5 | chlor a plynné anorganické sloučen 0,5 t | 1,04 MW |
| Vladislav Hanslík | Brodek u Prostějova | 5 | oxid uhelnatý (CO) 0,2 t | 0,47 MW |
| Javořice, a.s. - Ptení | Ptení | 4 | oxid uhelnatý (CO) 16,9 t | 18,80 MW |
| Hospodářské družstvo Určice, družstvo - farma Určice | Určice | 4 | oxid uhelnatý (CO) 12,8 t | 1,86 MW |
| HŽP a.s. - Prostějov | Prostějov | 4 | těkavé organické látky (VOC) 9,0 t | 2,33 MW |
| Amcor Flexibles Prostějov (DGPack) | Kralice na Hané | 4 | oxid uhelnatý (CO) 3,6 t | 7,86 MW |
| 2 MAX, s.r.o. - zpracování dřeva Mostkovice | Mostkovice | 4 | těkavé organické látky (VOC) 2,9 t | 0,95 MW |
| Strojírny Prostějov, a.s. | Prostějov | 4 | těkavé organické látky (VOC) 4,4 t | 1,19 MW |
| M.F.A. KONŠEL s.r.o. | Myslejovice | 4 | oxid uhelnatý (CO) 1,3 t | 0,59 MW |
| ZD Klenovice na Hané, družstvo - farma Klenovice na | Klenovice na Hané | 4 | oxid uhelnatý (CO) 0,4 t | nevykázán |
| MAKOVEC a.s. - Jateční závod MAKOVEC a.s. Kostelec n | Kostelec na Hané | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,3 t | 1,45 MW |
| WISCONSIN ENGINEERING CZ, s.r.o. - Vrahovická 41 | Prostějov | 4 | těkavé organické látky (VOC) 0,6 t | 0,98 MW |
| SEMO a.s. | Smržice | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | 1,96 MW |
| ŽALUZIE NEVA s.r.o. | Kralice na Hané | 4 | organické látky vyjádřené jako cel 0,0 t | nevykázán |
| PRECIOSA, a.s. - závod 02 | Brodek u Konice | 4 | těkavé organické látky (VOC) 0,0 t | 0,32 MW |
| ONIVON a.s. - provozovna Němčice nad Hanou | Němčice nad Hanou | 3 | oxid uhelnatý (CO) 7,3 t | nevykázán |
| AGROP NOVA a.s. - Plumlov | Plumlov | 3 | oxid uhelnatý (CO) 3,7 t | 2,50 MW |
| AGROP NOVA a.s. - Ptení | Ptení | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,9 t | 1,86 MW |
| PILA MINX, s.r.o. - průmyslové zpracování dřeva Niva | Niva | 3 | oxid uhelnatý (CO) 0,7 t | 0,50 MW |
| DT - Výhybkárna a strojírna, a.s. | Prostějov | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,8 t | 1,90 MW |
| GALA a.s. - Prostějov | Prostějov | 3 | těkavé organické látky (VOC) 1,0 t | 1,23 MW |
| KDK Mechanik | Kostelec na Hané | 3 | organické látky vyjádřené jako cel 0,4 t | nevykázán |
| VÍT SPÁČIL - prádelny a čistírny s.r.o. - Prostějov | Prostějov | 3 | těkavé organické látky (VOC) 0,3 t | 1,29 MW |
| ŽPSV s.r.o. závod Doloplazy | Doloplazy | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,3 t | 0,47 MW |
| AXTONE s.r.o. - Prostějov | Prostějov | 3 | oxid uhelnatý (CO) 0,2 t | nevykázán |
| HAJDIK Moulding s.r.o. lisovna | Olšany u Prostějova | 3 | organické látky vyjádřené jako cel 0,2 t | nevykázán |
| Windmöller Machinery - lakovna | Kralice na Hané | 3 | těkavé organické látky (VOC) 0,1 t | nevykázán |
| DEKWOOD s.r.o. - Němčice nad Hanou | Němčice nad Hanou | 3 | oxid uhelnatý (CO) 0,1 t | 0,35 MW |
| AGROS - sušička zrnin | Stařechovice | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,1 t | nevykázán |
| UNIAGRIS Pěnčín, a.s. - Dolní farma | Pěnčín | 3 | oxid uhelnatý (CO) 0,0 t | nevykázán |
| AGRO Rozstání, družstvo - farma Otinoves | Otinoves | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| Zemědělská společnost Terris Budětsko, a.s. - Farma | Budětsko | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | 1,00 MW |
| Haná ZZ s.r.o. - provozovna Hrubčice | Hrubčice | 2 | oxid uhelnatý (CO) 15,4 t | 2,82 MW |
| AGROPELLETS s.r.o. - provozovna Smržice | Smržice | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 10,5 t | 4,40 MW |
| Statek Kostelec na Hané, a.s. - farma Kostelec-kotel | Kostelec na Hané | 2 | oxid uhelnatý (CO) 11,6 t | 0,93 MW |
| BPS Ptení - bioplynová stanice | Ptení | 2 | oxid uhelnatý (CO) 8,9 t | 1,26 MW |
| Mubea Precision Steel Tubes s.r.o. | Kralice na Hané | 2 | oxid uhelnatý (CO) 9,0 t | 0,39 MW |
| Agrodružstvo Tištín - farma Tištín BPS | Tištín | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 9,4 t | 1,98 MW |
| Zemědělské družstvo Vrahovice - farma Prostějov | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 6,8 t | 1,39 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - sladov | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 5,9 t | 4,58 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Sídliš | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 5,1 t | 3,61 MW |
| UNIAGRIS energo, s.r.o. - provozovna Smržice | Smržice | 2 | oxid uhelnatý (CO) 3,8 t | 2,82 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Mozart | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 5,3 t | 3,61 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Tylova | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 4,0 t | 2,33 MW |
| Energo Kostelec 2 s.r.o. - provozovna Kostelec na Ha | Kostelec na Hané | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 4,8 t | 4,47 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - nemocn | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 4,5 t | 3,61 MW |
| MAEN, spol. s r.o. - skládka KO Novosady | Němčice nad Hanou | 2 | oxid uhelnatý (CO) 1,8 t | 0,93 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Krasic | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,8 t | 1,43 MW |
| MORAVSKÁ VODÁRENSKÁ, a.s. - Kralice na Hané | Kralice na Hané | 2 | oxid uhelnatý (CO) 1,2 t | 1,11 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka - Prostějov - Angl | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,1 t | 0,82 MW |
| PROFROST a.s. - plynové pece | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,1 t | 4,58 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Benešo | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,7 t | 0,82 MW |
| Remarkplast s.r.o. - granulace plastů | Bohuslavice | 2 | těkavé organické látky (VOC) 0,6 t | nevykázán |