| MEGAWASTE-EKOTERM, s.r.o. | Prostějov | 20 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,1 t | 1,07 MW |
| MAIER CZ, s.r.o. | Prostějov | 9 | oxid uhličitý 17,0 t | 4,93 MW |
| SLÉVÁRNA ANAH Prostějov, s.r.o. | Prostějov | 7 | oxidy síry vyjádřené jako oxid siř 8,3 t | nevykázán |
| Mubea Stabilizer Bar Systems s.r.o. | Prostějov | 6 | oxid uhelnatý (CO) 21,3 t | 1,88 MW |
| Toray Textiles Central Europe s.r.o. | Prostějov | 6 | oxid uhelnatý (CO) 10,3 t | 20,98 MW |
| DT Mostárna, a.s. - lakovna | Prostějov | 6 | těkavé organické látky (VOC) 3,1 t | 1,69 MW |
| LACHMAN INTERIER DESIGN, s.r.o. | Prostějov | 6 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,4 t | 0,41 MW |
| Mubea Stabilizer Bar Systems Hala 3 | Prostějov | 5 | oxid uhelnatý (CO) 10,2 t | 1,20 MW |
| Saint-Gobain Construction Products CZ a.s. - závod P | Prostějov | 5 | oxid uhelnatý (CO) 2,9 t | nevykázán |
| Mubea IT Spring Wire s.r.o. | Prostějov | 5 | oxid uhelnatý (CO) 5,7 t | 2,45 MW |
| Strojírny Prostějov | Prostějov | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 2,3 t | 1,19 MW |
| SIGNUM spol. s r.o. - závod Prostějov | Prostějov | 5 | chlor a plynné anorganické sloučen 0,5 t | 1,04 MW |
| HŽP a.s. - Prostějov | Prostějov | 4 | těkavé organické látky (VOC) 9,0 t | 2,33 MW |
| Strojírny Prostějov, a.s. | Prostějov | 4 | těkavé organické látky (VOC) 4,4 t | 1,19 MW |
| WISCONSIN ENGINEERING CZ, s.r.o. - Vrahovická 41 | Prostějov | 4 | těkavé organické látky (VOC) 0,6 t | 0,98 MW |
| DT - Výhybkárna a strojírna, a.s. | Prostějov | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,8 t | 1,90 MW |
| GALA a.s. - Prostějov | Prostějov | 3 | těkavé organické látky (VOC) 1,0 t | 1,23 MW |
| VÍT SPÁČIL - prádelny a čistírny s.r.o. - Prostějov | Prostějov | 3 | těkavé organické látky (VOC) 0,3 t | 1,29 MW |
| AXTONE s.r.o. - Prostějov | Prostějov | 3 | oxid uhelnatý (CO) 0,2 t | nevykázán |
| Zemědělské družstvo Vrahovice - farma Prostějov | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 6,8 t | 1,39 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - sladov | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 5,9 t | 4,58 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Sídliš | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 5,1 t | 3,61 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Mozart | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 5,3 t | 3,61 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Tylova | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 4,0 t | 2,33 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - nemocn | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 4,5 t | 3,61 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Krasic | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,8 t | 1,43 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka - Prostějov - Angl | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,1 t | 0,82 MW |
| PROFROST a.s. - plynové pece | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,1 t | 4,58 MW |
| ČEZ Energo - kogenerační jednotka Prostějov - Benešo | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,7 t | 0,82 MW |
| Zdeněk Vysloužil | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,4 t | nevykázán |
| PENAM, a.s. - pekárna Prostějov | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,5 t | 2,33 MW |
| SV výrobní, s.r.o. - Prostějov | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,3 t | nevykázán |
| ALPER a.s. - provozovna Prostějov | Prostějov | 2 | oxid uhelnatý (CO) 0,2 t | nevykázán |
| Palírna U Zeleného stromu a.s. | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,4 t | 5,90 MW |
| Domovní správa Prostějov - plynová kotelna Tylova | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,3 t | 6,33 MW |
| Domovní správa Prostějov, s.r.o. - sídl. E. Beneše | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | nevykázán |
| Domovní správa Prostějov - plynová kotelna Sídliště | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | 8,63 MW |
| Domovní správa Prostějov - plynová kotelna sídliště | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 7,18 MW |
| Domov seniorů Prostějov, p.o. - kotelna | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 1,02 MW |
| Bernhardt Fashion CZ, s.r.o. | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 0,95 MW |
| AGEL Středomoravská nemocniční a.s. | Prostějov | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 11,13 MW |
| HASPO, spol. s r.o. - stříkací kabina | Prostějov | 2 | těkavé organické látky (VOC) 0,0 t | nevykázán |
| HANAKOV, spol. s r.o. - povrchová úprava kovových ko | Prostějov | 2 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| TBG BETONMIX a.s. - Betonárna Prostějov | Prostějov | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,8 t | nevykázán |
| ZAPA beton a.s. - betonárna Prostějov | Prostějov | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,2 t | nevykázán |
| SaF - SERVIS, s.r.o. - chemická čistírna a prádelna | Prostějov | 1 | těkavé organické látky (VOC) 0,2 t | nevykázán |
| KOVO - LAKO s.r.o. | Prostějov | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| lakovna ADECOLOR s.r.o. | Prostějov | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| TIP, spol. s r.o. - prášková lakovna | Prostějov | 1 | organické látky vyjádřené jako cel 0,0 t | nevykázán |
| JARTECH s.r.o. | Prostějov | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| TAVRON s.r.o. | Prostějov | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| Domovní správa Prostějov, s.r.o. - sídl. Hloučela K1 | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Domovní správa Prostějov, s.r.o. - kotelna Anglická | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Domovní správa Prostějov, s.r.o. - kotelna Spojenců | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Domovní správa Prostějov, s.r.o. - kotelna Barákova | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Gymnázium Jiřího Wolkera Prostějov - plynová kotelna | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Hasičský záchranný sbor Olomouckého kraje - PS Prost | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Střední průmyslová škola a SOU strojírenské Prostějo | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Obchodní akademie Prostějov - plynová kotelna | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| MORAVSKÁ VODÁRENSKÁ, a.s. - Prostějov - Krapkova | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Statutární město Prostějov | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| OMV Česká republika, s.r.o. - Prostějov, Žešov | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| ČEPRO, a.s. - ČS PHM 418 Prostějov | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| ČEPRO, a.s. - ČS PHM 417 Mostkovice | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Kaufland ČR v.o.s. - Prostějov I | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Moděva, oděvní družstvo Konice - kotelna Prostějov | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| MOL Česká republika s.r.o. , ČS Prostějov | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| InterCora, s.r.o. - kotelna Prostějov | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Domovní správa Prostějov, s.r.o. - kotelna Okružní | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |
| Shell 8116 - Prostějov | Prostějov | — | nevykázáno | nevykázán |