| C-energy s.r.o. - Tábor | Tábor | 13 | oxid uhličitý 46 804 t | 125,45 MW |
| C-Energy Planá nad Lužnicí | Planá nad Lužnicí | 10 | oxid uhličitý 205 123 t | 210,85 MW |
| Martin Novák | Malšice | 7 | oxid uhelnatý (CO) 7,4 t | 1,01 MW |
| Aladeron a.s.-BPS Hroby | Radenín | 7 | oxid uhelnatý (CO) 6,8 t | 1,38 MW |
| Miloslav Drhovský | Malšice | 7 | oxid uhelnatý (CO) 5,6 t | 1,21 MW |
| Ing. Milan Basík | Tábor | 7 | oxid uhelnatý (CO) 4,9 t | 0,62 MW |
| DITA výrobní družstvo invalidů | Stádlec | 7 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 0,33 MW |
| PAVUS, a.s. | Veselí nad Lužnicí | 7 | oxid uhelnatý (CO) 0,1 t | nevykázán |
| ACO Industries Tábor s.r.o. | Sezimovo Ústí | 6 | styren 10,7 t | 1,67 MW |
| KOVOSVIT MAS Foundry, a.s. | Sezimovo Ústí | 6 | těkavé organické látky (VOC) 6,3 t | 0,76 MW |
| BRISK Tábor a.s. | Tábor | 6 | těkavé organické látky (VOC) 1,5 t | 0,86 MW |
| NET4GAS KS Veselí nad Lužnicí | Žíšov | 6 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | 219,62 MW |
| Vollmann MetalWorx s.r.o. | Planá nad Lužnicí | 6 | oxid uhelnatý (CO) 0,1 t | 0,78 MW |
| Zemědělské a obchodní družstvo PODHRADÍ - Choustník | Choustník | 6 | těkavé organické látky (VOC) 0,0 t | 1,43 MW |
| LAUFEN CZ s.r.o. - provozovna Bechyně | Bechyně | 5 | oxid uhelnatý (CO) 29,8 t | 12,83 MW |
| ERDING s.r.o. - centrální plynová kotelna Bechyně | Bechyně | 5 | oxid uhelnatý (CO) 15,8 t | 8,00 MW |
| Miroslav Drs - Bioplynová stanice Nedvědice | Soběslav | 5 | oxid uhelnatý (CO) 5,1 t | 1,32 MW |
| Zemědělské družstvo Opařany - Stadlec | Stádlec | 5 | oxid uhelnatý (CO) 3,3 t | 0,84 MW |
| Impregnace Soběslav s.r.o. | Soběslav | 5 | těkavé organické látky (VOC) 3,6 t | 2,74 MW |
| Kostelecké uzeniny - provozovna Planá | Planá nad Lužnicí | 5 | oxid uhelnatý (CO) 0,7 t | nevykázán |
| BRIKLIS spol. s r.o. - Malšice | Malšice | 5 | těkavé organické látky (VOC) 0,5 t | 0,34 MW |
| HOCHTIEF CZ a.s - Planá nad Lužnicí | Planá nad Lužnicí | 5 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,3 t | 0,36 MW |
| DITA výrobní družstvo invalidů /00028762/ | Tábor | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | nevykázán |
| KOH-I-NOOR Mladá Vožice a.s. | Mladá Vožice | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 0,1 t | 1,36 MW |
| ENVI-PUR, s.r.o. | Soběslav | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 0,50 MW |
| Zemědělské obchodní družstvo PODHRADÍ Choustník - ČS | Budislav | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 1,90 MW |
| STRABAG Asfalt s.r.o. - Obalovna Soběslav | Soběslav | 4 | oxid uhelnatý (CO) 12,3 t | nevykázán |
| COGEBI a. s. | Tábor | 4 | těkavé organické látky (VOC) 13,9 t | 1,31 MW |
| LATOP ENERGY s.r.o. - v | Chotoviny | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 4,0 t | 2,46 MW |
| C-Energy Špičková výtopna | Tábor | 4 | oxidy síry vyjádřené jako oxid siř 5,3 t | 19,95 MW |
| EFAFLEX - CZ s.r.o. | Opařany | 4 | těkavé organické látky (VOC) 4,3 t | 0,76 MW |
| JK Machinery | Tábor | 4 | organické látky vyjádřené jako cel 1,4 t | 0,38 MW |
| Emco spol. s.r.o., závod Vřesce | Ratibořské Hory | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,8 t | 0,67 MW |
| Pohřební a kremační ústav Tábor s.r.o. - Tábor | Tábor | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,9 t | nevykázán |
| Družina spol.,s r.o.-Sladovna Tábor | Tábor | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,6 t | 2,75 MW |
| LEGUAN POVRCHOVÉ ÚPRAVY s.r.o. | Žíšov | 4 | těkavé organické látky (VOC) 0,5 t | 0,41 MW |
| Strojírna Soběslav spol. s r.o. | Soběslav | 4 | organické látky vyjádřené jako cel 0,2 t | 0,66 MW |
| KOVOSVIT MAS Machine Tools, a.s. | Sezimovo Ústí | 4 | těkavé organické látky (VOC) 0,3 t | 1,15 MW |
| Zotavovna Vězeňské služby ČR PRACOV - Radimovice u Ž | Radimovice u Želče | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 0,88 MW |
| Zemědělská společnost Slapy - Bioplynová stanice Lom | Lom | 3 | oxid uhelnatý (CO) 10,8 t | 1,35 MW |
| Zemědělská společnost Čenkov a.s. | Malšice | 3 | oxid uhelnatý (CO) 9,8 t | 1,59 MW |
| VIALIT SOBĚSLAV spol. s r.o. - Soběslav | Soběslav | 3 | oxid uhelnatý (CO) 9,7 t | 0,38 MW |
| Dřevospol Šťastný Záhoří, spol. s r.o. - Záhoří | Záhoří | 3 | oxid uhelnatý (CO) 6,9 t | 0,97 MW |
| FRISCH HOLZ SYSTEMBAU s.r.o. - kotelna | Veselí nad Lužnicí | 3 | oxid uhelnatý (CO) 3,4 t | 2,91 MW |
| GRENA, a.s. | Veselí nad Lužnicí | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 2,5 t | 4,59 MW |
| Pila Pasák, a.s. - Planá nad Lužnicí | Planá nad Lužnicí | 3 | oxid uhelnatý (CO) 1,7 t | 2,06 MW |
| Obalovna Tábor Smylov | Tábor | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 3,0 t | 0,39 MW |
| COLAS CZ, a.s. Obalovna živičných směsí Sudoměřice | Sudoměřice u Bechyně | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,8 t | nevykázán |
| HYDAC spol. s r.o. | Planá nad Lužnicí | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 2,7 t | 1,22 MW |
| WindowStar s.r.o. | Planá nad Lužnicí | 3 | těkavé organické látky (VOC) 2,6 t | nevykázán |
| KOVO PLANÁ a.s. - Planá nad Lužnicí | Planá nad Lužnicí | 3 | organické látky vyjádřené jako cel 2,2 t | nevykázán |
| BETA AGRO Soběslav kotel Dvorce | Tučapy | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,1 t | 0,71 MW |
| Zemědělské družstvo Opařany Sušička obilí Opařany | Opařany | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 1,0 t | nevykázán |
| AGRA Březnice - Sušárna obilí | Březnice | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,9 t | nevykázán |
| ABADIA | Slapy | 3 | organické látky vyjádřené jako cel 0,5 t | nevykázán |
| Equidomus pila | Dráchov | 3 | oxid uhelnatý (CO) 0,5 t | 0,50 MW |
| FARMTEC a.s. - Jistebnice | Jistebnice | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,4 t | 0,57 MW |
| Českomoravský beton, a.s. - provozovna Soběslav | Soběslav | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,5 t | 0,32 MW |
| MABA Prefa spol. s r.o. - kotelna | Veselí nad Lužnicí | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,3 t | 0,73 MW |
| KATEV spol. s r.o. - chemická čistírna, Tábor | Tábor | 3 | těkavé organické látky (VOC) 0,2 t | 1,26 MW |
| DŘEVOTVAR - ŘEMESLA A STAVBY | Chýnov | 3 | organické látky vyjádřené jako cel 0,1 t | nevykázán |
| RM GASTRO, s.r.o. | Veselí nad Lužnicí | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 0,47 MW |
| MOTOR JIKOV Strojírenská a.s. - kotelna plynová a te | Soběslav | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 0,43 MW |
| Reprogen, a.s. - Suška Želeč | Želeč | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 1,09 MW |
| AL INVEST Břidličná, a.s., TAPA Tábor | Tábor | 2 | těkavé organické látky (VOC) 19,5 t | nevykázán |
| Zemědělské družstvo Dolní Hořice - bioplynová stani | Chýnov | 2 | oxid uhelnatý (CO) 9,1 t | 1,91 MW |
| JASANKA s.r.o. - Bioplynová stanice Krátošice | Krátošice | 2 | oxid uhelnatý (CO) 8,8 t | 1,41 MW |
| REPROGEN,a.s. - BPS Chlebov | Soběslav | 2 | oxid uhelnatý (CO) 7,8 t | 1,85 MW |
| SILON CZ s.r.o. - Planá nad Lužnicí | Planá nad Lužnicí | 2 | těkavé organické látky (VOC) 6,7 t | nevykázán |
| ČEVAK a.s. - AČOV Tábor | Tábor | 2 | oxid uhelnatý (CO) 3,6 t | 2,20 MW |