| RUMPOLD s.r.o. - Spalovna Strakonice | Strakonice | 20 | organické látky vyjádřené jako cel 0,9 t | nevykázán |
| A. Pöttinger, spol. s r.o. | Vodňany | 7 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 4,8 t | 4,68 MW |
| STROJÍRNA Vodňany spol. s r.o. - Vodňany, Stožická 8 | Vodňany | 7 | těkavé organické látky (VOC) 1,5 t | 0,78 MW |
| Pošumaví a.s.-Kompostárna | Střelské Hoštice | 7 | amoniak a soli amonné vyjádřené ja 0,0 t | nevykázán |
| ZEMCHEBA, s.r.o. - Chelčice | Chelčice | 5 | oxid uhelnatý (CO) 20,4 t | 15,79 MW |
| Sage Automotive Interiors, Strakonice Fabrics, s.r.o | Strakonice | 5 | oxid uhelnatý (CO) 5,2 t | nevykázán |
| QUINT spol. s r.o. - Katovice | Katovice | 5 | těkavé organické látky (VOC) 0,8 t | 0,38 MW |
| Zemědělské zásobování a nákup Strakonice a.s. - Rado | Radošovice | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,4 t | 1,36 MW |
| VISHAY ELECTRONIC spol. s.r.o. - Blatná ESTA B1 | Blatná | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 0,1 t | 0,64 MW |
| VISHAY ELECTRONIC spol. s.r.o. - kotelna II,III,IV | Blatná | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 0,2 t | 2,75 MW |
| ANIMO Žatec Sedlice | Sedlice | 5 | oxid uhelnatý (CO) 0,1 t | 0,51 MW |
| Agro Sedlice, a.s. | Sedlice | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 0,51 MW |
| Liqui B, ovocný lihovar Blatná | Blatná | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 1,31 MW |
| Výrobně obchodní družstvo Lidmovice | Skočice | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 1,75 MW |
| Zemědělské zásobování a nákup Strakonice a.s. - Blat | Blatná | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 0,0 t | 8,06 MW |
| Teplárna Strakonice, a.s. | Strakonice | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 103,7 t | 242,00 MW |
| Zemědělské družstvo Přešťovice BPS | Přešťovice | 4 | oxid uhelnatý (CO) 7,5 t | 1,80 MW |
| ČZ a.s. | Strakonice | 4 | tuhé znečišťující látky (TZL) 8,3 t | 14,43 MW |
| Keibel Maschinenbau s.r.o. | Radošovice | 4 | těkavé organické látky (VOC) 7,5 t | 1,85 MW |
| DENIOS s.r.o. | Strakonice | 4 | těkavé organické látky (VOC) 2,9 t | 0,69 MW |
| DURA Automotive CZ, k.s. | Blatná | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,7 t | 7,14 MW |
| DREVYS PRO s.r.o. | Předmíř | 4 | oxid uhelnatý (CO) 0,9 t | 0,62 MW |
| ESCO CZ PRODUCTION s.r.o. | Radomyšl | 4 | oxid uhelnatý (CO) 0,4 t | 0,99 MW |
| Vishay Electronic s.r.o. - Blatná, Paštická 1096 Sfe | Blatná | 4 | těkavé organické látky (VOC) 0,4 t | 1,13 MW |
| ESCO CZ PRODUKCION s.r.o - Radomyšl | Radomyšl | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,4 t | 1,84 MW |
| GD Druckguss s.r.o. | Vodňany | 4 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,4 t | nevykázán |
| ESCO CZ spol. s r.o. | Radomyšl | 4 | oxid uhelnatý (CO) 0,3 t | 1,84 MW |
| Technické služby Města Blatné s.r.o. - Blatná, krema | Blatná | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | nevykázán |
| Akrematorium, s.r.o. - Strakonice | Strakonice | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | nevykázán |
| VAFO Production s.r.o. provoz Číčenice | Číčenice | 3 | oxid uhelnatý (CO) 14,7 t | nevykázán |
| Výrobně obchodní družstvo Kadov - BPS | Kadov | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 10,0 t | 1,44 MW |
| Obaly Blatná, s.r.o. - kotelna - Blatná | Blatná | 3 | oxid uhelnatý (CO) 4,6 t | 1,56 MW |
| VAFO Production, s.r.o. provozovna Chelčice | Chelčice | 3 | oxid uhelnatý (CO) 2,5 t | nevykázán |
| Tesla Blatná, a.s. - Blatná, Palackého | Blatná | 3 | těkavé organické látky (VOC) 2,6 t | 1,73 MW |
| ZNAKON-mobilní recyklační linka GIPOREC | Sousedovice | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 2,2 t | nevykázán |
| AGRA GROUP a.s. - Střelské Hoštice | Střelské Hoštice | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,8 t | 0,31 MW |
| Plasm_Strakonice | Strakonice | 3 | organické látky vyjádřené jako cel 0,9 t | nevykázán |
| Linamar Structures Czechia s.r.o. | Strakonice | 3 | těkavé organické látky (VOC) 0,9 t | 0,86 MW |
| Vyšší odborná škola a Střední průmyslová škola Volyn | Volyně | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,5 t | 3,04 MW |
| Vertiv Czech Republic s.r.o. Nišovice | Nišovice | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,3 t | 0,75 MW |
| PVO SERVIS | Vodňany | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,4 t | 1,87 MW |
| Strakonická obalovna s.r.o. | Mutěnice | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | 0,39 MW |
| LEIFHEIT, s.r.o. - Blatná - Sádlov | Blatná | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | 2,40 MW |
| Zemědělské družstvo Novosedly - Bioplynová stanice | Novosedly | 2 | oxid uhelnatý (CO) 7,9 t | 1,83 MW |
| Zemědělské družstvo Bělčice - provozovna Bělčice | Bělčice | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 6,7 t | 2,39 MW |
| Aluprogress a.s. | Strakonice | 2 | tuhé znečišťující látky (TZL) 5,7 t | nevykázán |
| TEDOM a.s. - skládka TKO Vodňany | Vodňany | 2 | oxid uhelnatý (CO) 2,9 t | 0,39 MW |
| E.ON Energie, a.s. - KJ Blatná, Čechova | Blatná | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 3,4 t | 1,90 MW |
| RUMPOLD 01 - Vodňany s.r.o. - Vodňany, Stožická 1333 | Vodňany | 2 | těkavé organické látky (VOC) 2,5 t | nevykázán |
| ČEZ Energo - kotelna Volyně | Volyně | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 2,3 t | 3,67 MW |
| E.ON Energy Solutions - KJ Blatná, Čechova | Blatná | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,8 t | 1,90 MW |
| E.ON Energie, a.s. - KJ Blatná, Nad Lomnicí | Blatná | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,8 t | 1,18 MW |
| Laminar Medica (CE) s.r.o. - Vodňany, Číčenická 1271 | Vodňany | 2 | těkavé organické látky (VOC) 1,9 t | 2,33 MW |
| E.ON Energy Solutions - KJ Blatná, Nad Lomnicí | Blatná | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,4 t | 1,18 MW |
| EM Polar | Blatná | 2 | těkavé organické látky (VOC) 1,7 t | nevykázán |
| Vodňanská drůbež, a.s., závod Vodňany | Vodňany | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,9 t | 6,81 MW |
| OnSite_AstenJohnson | Strakonice | 2 | oxid uhelnatý (CO) 0,5 t | 0,51 MW |
| AstenJohnson, s.r.o. | Strakonice | 2 | těkavé organické látky (VOC) 0,5 t | nevykázán |
| DURA Automotive CZ, k.s. - provozovna Strakonice | Strakonice | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,3 t | 0,63 MW |
| Technické služby Strakonice s.r.o. - Strakonice | Strakonice | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 1,60 MW |
| Technické služby města Blatné, s.r.o. - Plynová kote | Blatná | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 2,07 MW |
| Jihočeská zelenina a.s. - Vodňany, Staropoštovská 10 | Vodňany | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 0,42 MW |
| PRIMA akciová společnost - Strakonice | Strakonice | 2 | organické látky vyjádřené jako cel 0,0 t | nevykázán |
| MBM WESTRA s.r.o. - Sousedovice | Sousedovice | 1 | těkavé organické látky (VOC) 3,0 t | nevykázán |
| ERB invest s.r.o. - Kamenolom Černětice | Volyně | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 2,8 t | nevykázán |
| Cemex Lom Černětice | Volyně | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 1,6 t | nevykázán |
| HERLIN spol. s r.o. - kamenolom Řečice | Blatná | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 1,4 t | nevykázán |
| HERLIN spol. s r.o. - kamenolom - Chlum | Chlum | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,8 t | nevykázán |
| Kámen a písek, spol. s r.o. Český Krumlov - Krty-Hra | Krty-Hradec | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,8 t | nevykázán |
| KAMENOLOMY ČR s.r.o. - kamenolom Nihošovice | Nihošovice | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,6 t | nevykázán |