| Václav Chmela - Galvanovna s.r.o. | Písek | 6 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 6,5 t | nevykázán |
| Faurecia Automotive Czech Republic s.r.o. | Písek | 6 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,8 t | 2,54 MW |
| ZVVZ MACHINERY, a.s. | Milevsko | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 10,7 t | nevykázán |
| Faurecia Components Písek s.r.o. - LEO (SMPG) - lako | Písek | 5 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,9 t | 4,08 MW |
| MASO UZENINY PÍSEK, a.s. | Písek | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,7 t | 6,70 MW |
| KTC INTERNATIONAL s.r.o., provozovna Oslov | Oslov | 5 | těkavé organické látky (VOC) 0,4 t | 0,88 MW |
| Vodňanská drůbež, a.s. Závod Mirovice | Mirovice | 5 | organické látky vyjádřené jako cel 0,0 t | 5,91 MW |
| AGRO, družstvo Záhoří - Záhoří | Vlastec | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 2,48 MW |
| Obec Ostrovec - Ostrovec | Ostrovec | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 0,52 MW |
| Zemědělské družstvo Kovářov - Lašovice | Kovářov | 5 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 1,94 MW |
| Teplárna Písek, a.s. - Teplárna Písek | Písek | 4 | oxidy síry vyjádřené jako oxid siř 62,8 t | 31,27 MW |
| ZVVZ ENERGO, s.r.o. - kotelna ZVVZ a.s., Milevsko | Milevsko | 4 | oxidy síry vyjádřené jako oxid siř 44,9 t | 19,00 MW |
| EUROVIA Asfalt s.r.o. - obalovna Lety | Lety | 4 | oxidy síry vyjádřené jako oxid siř 36,8 t | nevykázán |
| PF NÁBYTEK spol. s r.o. - Veselíčko - Bilina | Veselíčko | 4 | těkavé organické látky (VOC) 0,4 t | 1,32 MW |
| B a K production s.r.o. | Písek | 4 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,1 t | 0,36 MW |
| Teplárna Písek, a.s. - Výtopna Samoty | Písek | 4 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 19,13 MW |
| Bioplynová stanice Kestřany | Kestřany | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 6,1 t | 1,44 MW |
| Holzpack CZ, s.r.o. | Drhovle | 3 | oxid uhelnatý (CO) 5,0 t | 1,37 MW |
| Wotan Forest, a.s., Provozy Protivín | Protivín | 3 | oxid uhelnatý (CO) 4,2 t | 1,00 MW |
| POLATA s.r.o.- Milevsko, | Milevsko | 3 | organické látky vyjádřené jako cel 2,0 t | nevykázán |
| AISIN EUROPE MANUFACTURING CZECH s.r.o. | Písek | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 1,5 t | 2,94 MW |
| TOMEGAS - úložiště Branice | Okrouhlá | 3 | těkavé organické látky (VOC) 1,5 t | nevykázán |
| NOI CZ s.r.o. | Ostrovec | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,7 t | 2,90 MW |
| Ennovi Energy & Power Solutions Czech Republic s.r.o | Písek | 3 | těkavé organické látky (VOC) 0,7 t | nevykázán |
| LÁZNĚ HOTEL VRÁŽ s.r.o. - Vráž | Vráž | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,6 t | 0,57 MW |
| SWISS-METAL akciová společnost - lakovna - Milevsko | Milevsko | 3 | organické látky vyjádřené jako cel 0,4 t | nevykázán |
| BETON Písek, spol. s r.o. betonárna Písek | Písek | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,4 t | 0,50 MW |
| STRABAG Asfalt s.r.o. - Obalovna Písek | Písek | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,2 t | nevykázán |
| ZZN Pelhřimov a.s. - VKS Záhoří | Záhoří | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,3 t | 2,37 MW |
| Zařízení SMV - Červená n. Vlt. | Jetětice | 3 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 0,42 MW |
| Schneider Electric, a.s. - Písek | Písek | 3 | těkavé organické látky (VOC) 0,2 t | 1,59 MW |
| s. n. o. p. cz a.s. Písek | Písek | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,1 t | 0,77 MW |
| Zemědělské družstvo Chyšky - provozovna Chyšky | Chyšky | 3 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| Smart BioEnergy s.r.o. – provozovna Písek | Písek | 2 | oxid uhelnatý (CO) 20,0 t | 2,82 MW |
| Eneris s.r.o. - Smrkovice, Vydlaby | Písek | 2 | oxid uhelnatý (CO) 2,0 t | 0,49 MW |
| Jan Polata - Milevsko, Petrovická | Milevsko | 2 | těkavé organické látky (VOC) 2,1 t | nevykázán |
| Pivovar Protivín, a.s. - Protivín kotelna | Protivín | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,8 t | 5,41 MW |
| Galvanovna Duchoň s. r. o. | Čížová | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,3 t | nevykázán |
| ČEVAK a.s. - ČOV Písek | Písek | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,1 t | 1,51 MW |
| TINOSS s.r.o. - výkrmna kuřecích brojlerů Myšenec | Protivín | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 0,95 MW |
| Nemocnice Písek, a.s. | Písek | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 5,22 MW |
| Zemědělské družstvo Bernartice - Bernartice | Bernartice | 2 | oxidy dusíku vyjádřené jako oxid d 0,0 t | 0,53 MW |
| ODPADY PÍSEK s.r.o. - Písek, Smrkovice | Písek | 1 | methan 250,4 t | nevykázán |
| KAMENOLOMY ČR s.r.o. - kamenolom Lašovice | Kovářov | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 1,7 t | nevykázán |
| Kámen a písek, spol. s r.o. - Písek | Písek | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 1,7 t | nevykázán |
| KAMENOLOMY ČR s.r.o. - kamenolom Kožlí u Čížové | Předotice | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 1,3 t | nevykázán |
| RaVent - Milevsko, Sažinova | Milevsko | 1 | těkavé organické látky (VOC) 0,9 t | nevykázán |
| Českomoravský beton a.s. - provozovna Milevsko | Milevsko | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,3 t | nevykázán |
| FPM-BECON spol. s r.o. - Milevsko, Dukelská | Milevsko | 1 | těkavé organické látky (VOC) 0,3 t | nevykázán |
| Ing. Jiří Charvát - Pila Vráž | Vráž | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,2 t | nevykázán |
| ČR Beton - betonárna Mirotice | Mirotice | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,2 t | nevykázán |
| BERGER BETON spol. s r.o. - betonárna Písek | Písek | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,1 t | nevykázán |
| Green engineering Olešná | Olešná | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,1 t | nevykázán |
| Kámen a písek kamenolom Jistec | Ostrovec | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,1 t | nevykázán |
| Služby Města Milevska - skládka Jenišovice | Milevsko | 1 | methan 0,1 t | nevykázán |
| Truhlárna CH + K - truhlárna Milevsko | Milevsko | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| Truhlárna CH + K - truhlárna Nová Vráž | Vráž | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| UNIVERSAL HYDRAULIK CZ, u vlakového nádraží - staveb | Putim | 1 | těkavé organické látky (VOC) 0,0 t | nevykázán |
| VEBA PLYN, a.s. - Milevsko, Táborská | Milevsko | 1 | těkavé organické látky (VOC) 0,0 t | nevykázán |
| DŘEVOSERVIS-PROTIVÍN | Protivín | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| LB MINERALS, s.r.o., VJ Třeboňsko, těžebna Jehnědno | Albrechtice nad Vltavou | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| KŘÍŽ RECYCLING s.r.o. -Tavírna neželezných kovů | Mirovice | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| ARRBO s.r.o. - pila | Sepekov | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| OM PROTIVÍN a.s. | Protivín | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| Ing. Jiří Hájek | Olešná | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| Krajské školní hospodářství - provozovna Hůrky | Písek | 1 | tuhé znečišťující látky (TZL) 0,0 t | nevykázán |
| FaTo Plus s.r.o. - ČS PHM - Bernartice | Bernartice | — | nevykázáno | nevykázán |
| 1. základní škola T.G. Masaryka Milevsko, Jeřábkova | Milevsko | — | nevykázáno | nevykázán |
| Poliklinika Milevsko, spol. s r.o. - Milevsko, Jeřáb | Milevsko | — | nevykázáno | nevykázán |
| ČEVAK a.s. - ČOV Milevsko | Milevsko | — | nevykázáno | nevykázán |